История появления мощей в Мюнхене еще не до конца выяснена. Однако известно, что основание собранию св. мощей, доставленных в Мюнхен большей частью из Рима, было положено в 1577 г. герцогом Баварским Вильгельмом V (1548 —1626), которого в народе называли «Благочестивым», ибо всё свободное время герцог посвящал богослужениям, молитвам, чтению религиозной литературы и паломничествам.
Церковные историки связывают время появления в Мюнхенской Резиденции мощей свв. вифлеемских младенцев с годами правления герцога Вильгельма V Благочестивого, ушедшего в монастырь и там проведшего остаток жизни, а также его сыном Максимилианом I (1573—1651), герцогом (с 1597 г.), а позже — курфюрстом Баварии (с 1623 г.). Максимилиан I вместе с братьями — архиепископом Регенсбургским кардиналом Филиппом-Вильгельмом (1576 — 1598), архиепископом Кельнским Фердинандом (1577 — 1650) и герцогом Баварско-Лейхтенбергским Альбертом VI ( 1584 — 1666) продолжил дело отца по собиранию святых мощей для церкви св. Михаила и Богатой капеллы Резиденции. Отсюда большинство реликвий уже в недавнее время было перемещено в «Комнату Реликвий» Мюнхенской Резиденции.
С послевоенного времени в «Комнате Реликвий» не было православных молебнов: мощам Вифлеемских младенцев здесь могут поклониться лишь отдельные верующие. Но в мюнхенском Кафедральном храме РПЦЗ хранится маленький ковчежец с частицей мощей св. младенца Вифлеемского. Они были доставлены в Мюнхен из Святой Земли архиепископом Берлинско-Германским и Великобританским Марком.