Родился 10 ноября 1951 года.
В 1974 году окончил Московский университет им. М. В. Ломоносова.
С 1982 года — директор ФГБУ «Федеральный научно-исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н. Ф. Гамалеи» Минздрава России. С 2000 года — заведующий кафедрой инфектологии Медико-профилактического факультета послевузовского профессионального образования Московской медицинской академии им. И. М. Сеченова.
Член-корреспондент РАМН с 2000 года, академик РАМН с 2004 года, академик РАН с 2013 года — Отделение медицинских наук РАН.
Специалист в области молекулярной биологии патогенных микроорганизмов.
Направления научной деятельности: изучение молекулярно-генетической организации генов, детерминирующих синтез факторов патогенности у бактерий. А. Л. Гинцбург выдвинул и обосновал положение о том, что гены факторов патогенности входят в состав мобильных генетических элементов. Сформулировал концепцию, согласно которой одним из механизмов, позволяющих возбудителям сапронозов формировать эндемичные природные очаги, является способность патогенных бактерий сохранять в объектах внешней среды в межэпидемические периоды в некультивируемом состоянии.
Член редколлегий ведущих российских журналов по медицинской микробиологии: «ЖМЭИ» и «Молекулярная генетика, микробиология и вирусология».
Член президиума Всероссийского общества микробиологов и эпидемиологов им. И. И. Мечникова.
Лауреат премии Правительства РФ.
Награжден медалью П. Эрлиха.
