Во время нахождения в СИЗО Акименков почти потерял зрение, однако по медицинским показателям его освободить не могли, так как закон предусматривает освобождение только при полной слепоте.
Владимир Акименков содержится под стражей с 10 июня 2012 года. Его обвиняют в участии в массовых беспорядках на Болотной площади и применении насилия в отношении представителя власти. Арест обвиняемому неоднократно продлевался.
В начале ноября 2012 года писательница Людмила Улицкая просила главу Мосгорсуда Ольгу Егорову освободить Акименкова под подписку о невыезде.
По «болотному делу» проходят почти 30 человек. Большая часть из них ожидает суда под стражей. «Болотное дело» появилось после того, как на Болотной площади в Москве 6 мая 2012 года произошли столкновения между полицией и участниками демонстрации.