Напомним, что Козлов был убит 13 сентября 2006 года возле территории спорткомплекса "Спартак", в котором сотрудники Центробанка играли в футбол. Неизвестные открыли стрельбу в момент, когда банкир выходил с территории спорткомплекса. С огнестрельным ранением в голову и грудь Козлов был госпитализирован в 33-ю городскую больницу, где, не приходя в сознание, умер.
По факту убийства прокуратура Москвы возбудила уголовное дело по ч. 2 ст.105 УК РФ (убийство двух и более лиц). 16 октября того же года Басманный суд Москвы выдал санкцию на арест подозреваемых в убийстве. О том, что дело об убийстве Козлова фактически раскрыто, заявил еще 5 декабря генпрокурор РФ Юрий Чайка. По подозрению в убийстве были задержаны трое граждан Украины. Из показаний обвиняемых в убийстве следует, что конфликт между Андреем Козловым и заказчиком развивался в течение двух месяцев.
Предполагаемых исполнителей убийства Андрея Козлова - 35-летних граждан Украины Алексея Половинкина, Максима Прогляду и Александра Белокопытова - арестовали в начале декабря. По версии следствия, первый стрелял в зампреда ЦБ и поддерживал связь с посредником, второй застрелил водителя господина Козлова Александра Семенова, а третий помог киллерам скрыться с места убийства. При этом в слежке за банкиром участвовали все трое. Украинцам были предъявлены обвинения по соответствующим статьям УК России: исполнителям Половинкину и Прогляду инкриминировали убийство двух человек в составе группы по предварительному сговору, а водителю Белокопытову - пособничество убийцам. Обвиняемые признали, что преступление они совершили по найму.
В Генпрокуратуре считают основной версией покушения на банкира его профессиональную деятельность. В Центробанке Козлов курировал вопросы выдачи лицензий банковским организациям.
Отметим, что в конце сентября - вскоре после убийства, большинство россиян считало, что это преступление не будет раскрыто. По итогам опроса, проведенного ВЦИОМ 23-24 сентября, такого мнения придерживались 66% опрошенных. В том, что убийцы будут найдены, были уверены всего 17% респондентов, и еще столько же затруднились с прогнозом. Свыше половины респондентов - 56% - считали, что убийство Козлова - месть со стороны криминальных банковских кругов. 14% считали, что цель убийства более масштабна - дестабилизировать ситуацию в экономике и политике. О попытке ограбления заявили 4%, об убийстве на бытовой почве или по ошибке - по 1%.