После октябрьского переворота и в связи с распадом Российской Империи, появлением независимого Латвийского государства, Рижская епархия оставалась 4 года без правящего архиерея. Только после того, как на Рижскую кафедру был назначен латыш Иоанн (Поммер), Латвийские власти приняли сторону РПЦ. По ходатайству Архиепископа Иоанна, Синод РПЦ даровал Латвийской церкви внутреннюю автономию в делах управления. Авторитет Латвийской Церкви при Владыке Иоанне значительно вырос и укрепился. В 1925 году Владыка Иоанн был избран в латвийский сейм, где он принялся ревностно отстаивать интересы Латвийской церкви и русской диаспоры. Владыка Иоанн стал одним из самых видных церковных и государственных деятелей Латвии того времени. Единственной опорой для проживающий в Латвии русских была Латвийская Православная Церковь, возглавляемая Владыкой Архиепископом Иоанном (Поммером).Все это не могло вызывать яростной ненависти фашиствующих националистов, которые при поддержке властей и спецслужб Латвии в ночь с 11 на 12 октября 1934 года, ровно 85 лет назад, зверски убили Владыку в его пригородной резиденции и сожгли.
После зверского убийства Владыки Иоанна под давлением антироссийских властей Латвии Латвийская Церковь самовольно перешла в юрисдикцию Константинопольского Патриархата.
На Юбилейном Архиерейском Собора 2000 года Владыка Архиепископ Иоанн (Поммер) был причислен к лику общецерковных новомучеников Российских.